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Characterization of the fungal and bacterial microbiomes in settled dust from indoor domestic spaces in homes near a subtropical estuarine ecosystem
Hernández Escobar, Anais
Hernández Escobar, Anais
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Abstract
A next-generation sequencing approach was used to survey household dust microbiomes for potential asthma triggers in kitchens, bathrooms, and bedrooms of homes experiencing varying flood‑exposure levels from the Caño MartÃn Peña community of Puerto Rico. Sequencing analyses were conducted on samples collected before and after a cleaning and disinfection intervention, which was implemented to evaluate the effectiveness of mitigating potential asthma triggers. Results revealed that fungal and bacterial microbiomes were dominated by populations highly adapted to saline conditions rather than conventional microbial asthma triggers. Notably, halophilic fungi were found in flood‑prone and flooded bedrooms, while human‑associated microbes were distributed in every household area. Although the intervention reduced many microbial populations, it also reshaped indoor microbiomes by promoting niche‑specific groups. The shifts provoked by mitigation measures should be examined in greater depth to assess their implications for human health and indoor air quality.
Técnicas de secuenciación de nueva generación fueron utilizadas para detectar desencadenantes de asma en microbiomas del polvo doméstico asociado a cocinas, baños y dormitorios de viviendas con distintos niveles de exposición a inundaciones en la comunidad del Caño MartÃn Peña (Puerto Rico). Se analizaron muestras antes y después de una intervención de limpieza y desinfección para evaluar su eficacia como medida de mitigación. Los resultados mostraron que los microbiomas fúngicos y bacterianos estaban dominados por poblaciones altamente adaptadas a condiciones salinas, más que por desencadenantes microbianos convencionales. Hongos halófilos fueron detectados en dormitorios de zonas inundables y propensas a inundaciones, mientras que microbios asociados al humano se distribuyeron en todas las áreas. Aunque la intervención redujo muchas poblaciones microbianas, también reconfiguró los microbiomas interiores al favorecer grupos especÃficos a ciertos nichos. Estas alteraciones deben estudiarse con mayor profundidad para determinar su impacto en la salud humana y la calidad del aire interior.
Técnicas de secuenciación de nueva generación fueron utilizadas para detectar desencadenantes de asma en microbiomas del polvo doméstico asociado a cocinas, baños y dormitorios de viviendas con distintos niveles de exposición a inundaciones en la comunidad del Caño MartÃn Peña (Puerto Rico). Se analizaron muestras antes y después de una intervención de limpieza y desinfección para evaluar su eficacia como medida de mitigación. Los resultados mostraron que los microbiomas fúngicos y bacterianos estaban dominados por poblaciones altamente adaptadas a condiciones salinas, más que por desencadenantes microbianos convencionales. Hongos halófilos fueron detectados en dormitorios de zonas inundables y propensas a inundaciones, mientras que microbios asociados al humano se distribuyeron en todas las áreas. Aunque la intervención redujo muchas poblaciones microbianas, también reconfiguró los microbiomas interiores al favorecer grupos especÃficos a ciertos nichos. Estas alteraciones deben estudiarse con mayor profundidad para determinar su impacto en la salud humana y la calidad del aire interior.
Description
Date
2025-05-14
Journal Title
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Keywords
Caño MartÃn Peña, Asthma triggers, Indoor environment, Next generation sequencing, Microbial community