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Weak population structure detected in the commercially important deep-sea queen snapper (ππ΅π¦ππͺπ΄ π°π€πΆππ’π΅πΆπ΄) in Puerto Rico
GonzΓ‘lez GarcΓa, MarΓa del Pilar
GonzΓ‘lez GarcΓa, MarΓa del Pilar
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Abstract
The queen snapper, Etelis oculatus (Valenciennes, 1828), is part of the deep-water snapper complex; an important commercial species in the US Caribbean fishery. However, little is known about the biology and ecology of this species. This study sought to detect the presence of a fine-scale population structure and genetic diversity, as assessed through SNPs derived from the Restriction site Associated DNA Sequencing technique. Results estimated a weak population structure and low genetic diversity in our samples. However, principal component analysis and a model-based clustering method did illustrate a fine-scale subpopulation structure among sampling sites from this study. These results are comparable to the genetic and dispersal patterns observed in shallow-water snapper species in Puerto Rico. This study addressed questions of connectivity that are crucial to understanding the ecological role and biological life historyof the queen snapper which is useful for effective management and conservation of this culturally and commercially important fishery.
El cartucho, Etelis oculatus (Valenciennes, 1828), forma parte del complejo de pargos de aguas profundas y es una de las especies mΓ‘s importante en la pesca comercial en el Caribe de Estados Unidos. Se sabe poco sobre la biologΓa y ecologΓa de esta especie. En este estudio se evaluΓ³ la presencia de la estructura poblacional a escala fina y se cuantificΓ³ la diversidad genΓ©tica mediante SNPs derivados a travΓ©s de la tΓ©cnica de SecuenciaciΓ³n de ADN Asociada a Sitios de RestricciΓ³n (RADSeq). Se estimΓ³ que hay una estructura poblacional dΓ©bil y una baja diversidad genΓ©tica en nuestras muestras. Sin embargo, el anΓ‘lisis de componentes principales y un mΓ©todo de agrupamiento basado en modelos Bayesianos detectaron una estructura de subpoblaciones de escala fina entre los sitios de muestreo en este estudio. Nuestros resultados han revelado patrones genΓ©ticos y de dispersiΓ³n comparables a los observados en otras especies de pargos de aguas someras en Puerto Rico. Es crucial mejorar nuestra comprensiΓ³n del aspecto ecolΓ³gico y biolΓ³gico del cartucho para gestionar y conservar de manera eficaz esta especie, ya que la presiΓ³n pesquera en Puerto Rico se ha extendido a especies que habitan en aguas profundas.
El cartucho, Etelis oculatus (Valenciennes, 1828), forma parte del complejo de pargos de aguas profundas y es una de las especies mΓ‘s importante en la pesca comercial en el Caribe de Estados Unidos. Se sabe poco sobre la biologΓa y ecologΓa de esta especie. En este estudio se evaluΓ³ la presencia de la estructura poblacional a escala fina y se cuantificΓ³ la diversidad genΓ©tica mediante SNPs derivados a travΓ©s de la tΓ©cnica de SecuenciaciΓ³n de ADN Asociada a Sitios de RestricciΓ³n (RADSeq). Se estimΓ³ que hay una estructura poblacional dΓ©bil y una baja diversidad genΓ©tica en nuestras muestras. Sin embargo, el anΓ‘lisis de componentes principales y un mΓ©todo de agrupamiento basado en modelos Bayesianos detectaron una estructura de subpoblaciones de escala fina entre los sitios de muestreo en este estudio. Nuestros resultados han revelado patrones genΓ©ticos y de dispersiΓ³n comparables a los observados en otras especies de pargos de aguas someras en Puerto Rico. Es crucial mejorar nuestra comprensiΓ³n del aspecto ecolΓ³gico y biolΓ³gico del cartucho para gestionar y conservar de manera eficaz esta especie, ya que la presiΓ³n pesquera en Puerto Rico se ha extendido a especies que habitan en aguas profundas.
Description
Date
2023-10-08
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Journal Issue
Keywords
Queen snapper - Puerto Rico, Restriction site-associated DNA sequencing (RADSeq), Population Structure, Genetic Diversity