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Application of principal component analysis in the design of substrates for surface enhanced Raman scattering (SERS) to detect proteins present in buffer solution

dc.contributor.advisor Resto Irizarry, Pedro J.
dc.contributor.author Martínez Julca, Milton A.
dc.contributor.college College of Engineering en_US
dc.contributor.committee Romañach, Rodolfo
dc.contributor.committee De Jesús Ruiz, Marco A.
dc.contributor.committee Hernández Rivera, Samuel P.
dc.contributor.department Other en_US
dc.contributor.representative Rivera, Rosita
dc.date.accessioned 2020-01-27T19:17:53Z
dc.date.available 2020-01-27T19:17:53Z
dc.date.issued 2019-12-09
dc.description.abstract Therapeutic cells are a key component in the future of medicine. Biosensing methods that can monitor cell quality attributes in a rapid, real-time manner are required to scale-up the manufacturing of high-quality therapeutic cells. In the present work, ATR-FTIR and Raman spectroscopy are used to discriminate protein in solutions. Results show the ability to detect proteins as a function of their covalent bonds, but with low signal/noise ratios. SERS was implemented using Au thin films deposited on Si, Polydimethylsiloxane (PDMS), micro-PDMS and polycarbonate substrates to increase signal/noise ratios. Au thin films were made using Physical Vapor Deposition (PVD). These were analyzed using AFM and Raman Spectroscopy. Au thin films having a thickness of 10 nm were obtained and showed a suitable roughness (around 2.6-51.18nm). Spectral analysis was combined with multivariate analysis using Principal Components Analysis (PCA) to differentiate between substrates as a function of their chemical composition. en_US
dc.description.abstract Células terapéuticas son un componente clave en el futuro de la medicina. Métodos de biosensores que pueden monitorear atributos cualitativos en una manera rápida, tiempo real son requeridos para la manufactura a alta escala de células terapéuticas de alta calidad. En el presente trabajo, ATR-FTIR y espectroscopia Raman son usadas para discriminar proteínas en soluciones. Resultados muestran la habilidad para detectar proteínas en función de sus enlaces covalentes, pero con bajas proporciones de señal/ruido. SERS fue implementado usando películas delgadas de oro depositadas en sustratos de Si, Polidimetilsiloxano (PDSM), micro-PDMS, y policarbonato para incrementar las proporciones de señal/ruido. Películas delgadas de oro fueron hechas usando Deposición Física de Vapor (PVD por sus siglas en inglés). Películas delgadas de oro fueron hechas usando Deposición Física de Vapor. Estas fueron analizadas usando AFM y espectroscopia Raman. Películas delgadas de oro teniendo un espesor de 10 nm fueron obtenidas y mostraron una rugosidad adecuada (alrededor 2.6-51.18nm). Análisis espectral fue combinado con análisis multivariable usando Análisis de Componentes Principales (PCA, por sus siglas en inglés) para diferenciar entre sustratos como función de su composición química. en_US
dc.description.graduationSemester Fall en_US
dc.description.graduationYear 2019 en_US
dc.description.sponsorship The NSF under Grant EEC-1648035 (Engineering Research Center for Cell Manufacturing Technologies (CMaT)). en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.11801/2534
dc.language.iso en en_US
dc.rights Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International *
dc.rights.holder (c) 2019 Milton Alberto Martinez Julca en_US
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ *
dc.subject Principal Component Analysis, SERS, Au thin films, Raman, Cell Manufacturing en_US
dc.subject.lcsh Cellular therapy en_US
dc.subject.lcsh Thin films -- Electrical properties en_US
dc.subject.lcsh Raman spectroscopy en_US
dc.subject.lcsh Physical vapor deposition en_US
dc.subject.lcsh Principal components analysis en_US
dc.subject.lcsh Multivariate analysis en_US
dc.subject.lcsh Proteins en_US
dc.title Application of principal component analysis in the design of substrates for surface enhanced Raman scattering (SERS) to detect proteins present in buffer solution en_US
dc.type Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
thesis.degree.discipline Bioengineering en_US
thesis.degree.level M.S. en_US
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