Publication:
Phylogeny of five species of Anilocra Leach 1818 (Isopoda: Cymothoidae) from Puerto Rico and the Virgin Islands

dc.contributor.advisor Williams, Lucy B.
dc.contributor.author Acevedo Méndez, Geidy
dc.contributor.college College of Arts and Sciences - Sciences en_US
dc.contributor.committee Williams, Ernest H.
dc.contributor.committee Cafaro, Matías J.
dc.contributor.department Department of Biology en_US
dc.contributor.representative Morales, Betsy
dc.date.accessioned 2018-05-16T17:17:47Z
dc.date.available 2018-05-16T17:17:47Z
dc.date.issued 2011
dc.description.abstract Members of the genus Anilocra Leach 1818 are large external isopod parasites of a variety of coral reef associated fishes. In the Caribbean Sea, this genus is represented by nine species whose descriptions are based solely on their morphology. Their disjunct geographic distributions and host specificity suggests varying degrees of incipient speciation. This study used mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 gene sequences to elucidate phylogenetic relationships of five species of Anilocra from Puerto Rico and the Virgin Islands through parsimony, maximum likelihood, and Bayesian inference. The results show that the Caribbean Anilocra species form a monophyletic group and are not closely related to A. physodes, the type species of the genus. Parsimony and Bayesian inference analyses recovered three clades: clade A (A. chromis), clade B (A. holocentri), and clade C (A. acanthuri, A. chaetodonti, A. haemuli), while maximum likelihood analyses only recovered clade A and C. These analyses depict A. chromis as the basal species and A. chaetodontis as the most recently evolved species of the Caribbean Anilocra. Phylogenetic reconstructions show population structure based on host for A. haemuli and based on geographical location for A. chaetodontis, which suggest that each of these species might represent cryptic species with morphological stasis.
dc.description.abstract Los miembros del género Anilocra Leach 1818 son isópodos parásitos externos de una variedad de peces asociados a arrecifes de coral. En el Mar Caribe este género está representado por nueve especies cuyas descripciones están basadas solamente en su morfología. Su distribucion geográfica disjunta y la especificidad de hospederos sugieren varios grados de especiación incipiente. Este estudio utilizó secuencias del gen mitocondrial citocromo c oxidasa subunidad 1 para elucidar las relaciones filogenéticas de cinco especies de Anilocra de Puerto Rico y de las Islas Vírgenes por medio de análisis de parsimonia, máxima verosimilitud e inferencia bayesiana. Los resultados muestran que las especies de Anilocra del Caribe forman un grupo monofilético y no están relacionadas a A. physodes, la especie tipo del género. Los análisis de parsimonia e inferencia bayesiana recuperaron tres clados: clado A (A. chromis), clado B (A. holocentri) y clado C (A. acanthuri, A. chaetodonti, A. haemuli), mientras que los análisis de máxima verosimilitud sólo recuperaron el clado A y C. Estos análisis muestran a A. chromis como la especie basal y a A. chaetodontis como la especie que ha evolucionado más reciente dentro de Anilocra del Caribe. Las reconstrucciones filogenéticas muestran una estructura poblacional basada en hospedero para A. haemuli y una estructura poblacional basada en localidad geográfica para A. chaetodontis, lo cual sugiere que estas especies pueden ser especies crípticas con estasis morfológico.
dc.description.graduationSemester Fall en_US
dc.description.graduationYear 2011 en_US
dc.description.sponsorship Tthe CNY-PR Alliance for Graduate Education and Professoriate Program for the financial support en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.11801/656
dc.language.iso en en_US
dc.rights.holder (c) 2011 Geidy Acevedo Méndez en_US
dc.rights.license All rights reserved en_US
dc.subject Anilocra Leach en_US
dc.subject Isopod parasites en_US
dc.subject Coral reef associated fishes en_US
dc.subject Caribbean Anilocra species en_US
dc.subject.lcsh Phylogeny--Molecular aspects en_US
dc.subject.lcsh Anilocra--Phylogeny--Puerto Rico en_US
dc.subject.lcsh Isopoda--Phylogeny--Puerto Rico en_US
dc.subject.lcsh Anilocra--Phylogeny--Virgin Island en_US
dc.subject.lcsh Isopoda--Phylogeny--Virgin Island en_US
dc.subject.lcsh Anilocra--Morphology en_US
dc.title Phylogeny of five species of Anilocra Leach 1818 (Isopoda: Cymothoidae) from Puerto Rico and the Virgin Islands en_US
dc.type Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
thesis.degree.discipline Biology en_US
thesis.degree.level M.S. en_US
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