Caracterización morfológica y molecular de hongos fitopatógenos de suelo e identificación de bacterias follares en el cultivo de cebolla

Abstract

The objectives of the present investigation were to characterize morphological and molecularly some soilborne phytopathogenic fungi and identify bacteria associated to onion foliage in southern Puerto Rico. Thirteen representative isolates of Fusarium, 4 of Alternaria and 4 of Phoma were selected and classified at species level. ITS (Internal Transcribed Spacer) of the ribosomal DNA (rADN) was amplified. Fungal isolates were identified as Fusarium solani, F. equiseti, Alternaria tenuissima, a non-taxonomically described group of Alternaria spp. (semi-arborescent), Phoma putaminun and P. macrostoma var. incolorata. Pathogenicity tests performed in-vitro showed that Fusarium solani and F. equiseti caused damage to onion’s roots but not under field conditions. Phoma spp. isolates showed erratic behavior in both tests. Thirty nine bacterial isolates were found associated with onion foliage. Nineteen of them have phytopathogenic potential and belong to the genera Acidovorax, Burkholderia, Clavibacter, Curtobacterium, Pseudomonas and Xanthomonas. Pathogenicity tests showed that six out of eight isolates produced symptoms in onion plants (Pseudomonas sp, Xanthomonas sp, Acidovorax avenae supsp. citrulli and Burkholderia glumae species).

El propósito de la presente investigación fue caracterizar morfológica y molecularmente algunos hongos fitopatógenos de suelo y aislar e identificar bacterias fitopatógenas asociadas al follaje del cultivo de cebolla en la zona sur de Puerto Rico. Se seleccionaron 13 aislados tipo de Fusarium, 4 de Alternaria y 4 de Phoma, los cuales fueron clasificados a nivel de especie. Se amplificó la región ITS (Internal Transcribed Spacer) del ADN ribosomal (rADN). Las especies de hongos identificadas fueron: Fusarium solani, F. equiseti, Alternaria tenuíssima, Alternaria spp. pertenecientes a un grupo no descrito taxonomicamente (“semi-arborescente”), Phoma putaminun y P. macrostoma var. incolorata. Los aislados de Fusarium solani y F. equiseti produjeron daños a las raíces de cebolla en las pruebas de patogenicidad in-vitro pero no en condiciones de campo. Los aislados de Phoma mostraron un comportamiento errático en ambas pruebas. Se encontraron 39 diferentes aislados de bacterias asociadas al follaje de cebolla de los cuales 19 aislados poseen potencial fitopatogénico y pertenecen a los géneros Acidovorax, Burkholderia, Clavibacter, Curtobacterium, Pseudomonas y Xanthomonas. Las pruebas de patogenicidad demostraron que seis de los ocho aislados produjeron síntomas en las plantas de cebolla y son: Pseudomonas sp, Xanthomonas sp, Acidovorax avenae subps. citrulli y Burkholderia glumae.