Publication:
Description of the prokaryotic community in the bivalve Lucina pectinata in marine wetlands of Cabo Rojo, Puerto Rico!
Description of the prokaryotic community in the bivalve Lucina pectinata in marine wetlands of Cabo Rojo, Puerto Rico!
Authors
Avilés Vázquez, Christian O.
Embargoed Until
Advisor
López Garriga, Juan
College
College of Agricultural Sciences
Department
Department of Crops and Agro-Environmental Sciences
Degree Level
M.S.
Publisher
Date
2011
Abstract
Lucina pectinata is a large bivalve that belongs to the family Lucinidae; it is generally found in marine wetlands of the Caribbean, deeply burrowed in black mud with high sulfide concentrations. L. pectinata prokaryotic community was extracted by the Percoll cushion method and its cell populations were analyzed through Flow Cytometry. Fluorescence and conventional microscopy were performed to validate the data obtained through FCM. After analyzing the data, bacteria populations with a length of, approximately, 3μm and 6μm were defined. Statistical analyses were performed to determine the existence of a proportional relationship within the cell sizes in the populations according to the bivalve sizes, and the number of cell populations in relationship with the bivalve sizes. A statistical analysis was also performed to determine if the use of one ctenidia or two had an effect on the amount of populations reported by FCM. The statistical data supports that the bacteria cell sizes and the total populations are independent of bivalve size and the number of ctenidias used. Furthermore, the data supports the hypothesis that the presented symbiotic pattern is characteristic to bivalves present in environments with relatively high concentrations of hydrogen sulfide and low concentrations of oxygen.!
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Lucina pectinata es un bivalvo de tamaño promedio, perteneciente a la familia Lucinidae, encontrado en el suelo de humedales marinos en el Caribe. La comunidad bacteriana de L. pectinata fue extraída por el método de “Percoll Cushion” y analizada por citometría de flujo (FCM). Se realizó microscopía de fluorescencia y microscopía de luz convencional para validar los datos obtenidos a través del FCM. Un ánalisis molecular del 16 S rADN se realizó para comparar el número de poblaciones descritas a través del FCM con las del ensayo molecular. Luego de analizar los datos, las poblaciones bacterianas fluctuaban en un rango aproximado entre 3μm y 6μm. Se realizaron análisis estadísticos para determinar la existencia de una relación proporcional entre el tamaño de las celulas en las poblaciones y el tamaño de los bivalvos, de igual manera con el número de poblaciones célulares totales en relación con el tamaño de los bivalvos. Un análisis de varianza se realizó para determinar si el uso de unatenidia o dos tuvo un efecto sobre el número de poblacionesreportados por FCM. Los análisis estadísticos no revelaron evidencia para definir relaciones proporcionales entre las poblaciones y el tamaño de los bivalvos, las células en las poblaciones o el uso de una tenidia o dos; Las poblaciones bacterianas y los tamaños de las células en ellas es independiente del tamaño del bivalvo. Los datos apoyan la hipótesis de que la relación simbiótica entre L. pectinata es semejante a las de otros bivalvos presentes en ambientes con altas concentraciones de sulfuro de hidrógeno y bajas concentraciones de oxígeno.
Lucina pectinata es un bivalvo de tamaño promedio, perteneciente a la familia Lucinidae, encontrado en el suelo de humedales marinos en el Caribe. La comunidad bacteriana de L. pectinata fue extraída por el método de “Percoll Cushion” y analizada por citometría de flujo (FCM). Se realizó microscopía de fluorescencia y microscopía de luz convencional para validar los datos obtenidos a través del FCM. Un ánalisis molecular del 16 S rADN se realizó para comparar el número de poblaciones descritas a través del FCM con las del ensayo molecular. Luego de analizar los datos, las poblaciones bacterianas fluctuaban en un rango aproximado entre 3μm y 6μm. Se realizaron análisis estadísticos para determinar la existencia de una relación proporcional entre el tamaño de las celulas en las poblaciones y el tamaño de los bivalvos, de igual manera con el número de poblaciones célulares totales en relación con el tamaño de los bivalvos. Un análisis de varianza se realizó para determinar si el uso de unatenidia o dos tuvo un efecto sobre el número de poblacionesreportados por FCM. Los análisis estadísticos no revelaron evidencia para definir relaciones proporcionales entre las poblaciones y el tamaño de los bivalvos, las células en las poblaciones o el uso de una tenidia o dos; Las poblaciones bacterianas y los tamaños de las células en ellas es independiente del tamaño del bivalvo. Los datos apoyan la hipótesis de que la relación simbiótica entre L. pectinata es semejante a las de otros bivalvos presentes en ambientes con altas concentraciones de sulfuro de hidrógeno y bajas concentraciones de oxígeno.
Keywords
Flow Cytometry,
Lucina pectinata,
Lucinidae
Lucina pectinata,
Lucinidae
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Persistent URL
Cite
Avilés Vázquez, C. O. (2011). Description of the prokaryotic community in the bivalve Lucina pectinata in marine wetlands of Cabo Rojo, Puerto Rico! [Thesis]. Retrieved from https://hdl.handle.net/20.500.11801/1298