Incidence of ochratoxin A in green and roasted coffee beans from Puerto Rico

Abstract

Ochratoxin A (OTA) is a carcinogenic mycotoxin for animals and humans produced by Aspergillus spp. and Penicillium spp., which has been associated with coffee and other foods. The aim of this study is to analyze ochratoxin A and identify fungi contaminating coffee beans from Puerto Rico. A total of 11 green coffee samples provided by ASDA (Administración de Servicios y Desarrollo Agropecuario) were collected and 200 grams of each sample were roasted to evaluate its effect on OTA levels. Ochratoxin A was quantified using Neogen’s AccuScan Gold Reader and Reveal Q+ kit for ochratoxin A. Beans from each sample were plated on Dichloran 18% Glycerol Agar for fungal isolation and isolates were identified by DNA extraction and sequencing using ITS 1 and ITS4 primers. Only one sample had OTA levels (12.7 ppb green, 11.9 ppb roasted) above the European Union limits. Most samples had OTA levels below the detection limit of the method used, which is 2 ppb. Aspergillus spp. were most commonly found fungi, with Aspergillus niger having the highest incidence (31%). No significant difference in OTA levels were found between green and roasted beans.

La ocratoxina A, es una micotoxina potencialmente carcinogénica para animales y humanos, que se ha asociado al café y otros alimentos. El objetivo de este estudio es analizar ocratoxina A e identificar hongos presentes en café de Puerto Rico. Se recogieron un total de 11 muestras de café verde proporcionadas por ASDA (Administración de Servicios y Desarrollo Agrícolas) y se tostaron 200 gramos de cada muestra para evaluar el efecto de tueste sobre los niveles de OTA. Granos de cada muestra se sembraron en agar de diclorán con glicerol al 18% para aislar los hongos y posteriormente estos se identificaron mediante extracción y secuenciación de ADN. La ocratoxina A se cuantificó utilizando el kit AccuScan Gold Reader y Reveal Q+ para ocratoxina A de la compañía Neogen. Solo una muestra tenía niveles de OTA (12.7 ppb en verde, 11.7 ppb en tostado) por encima de los límites establecidos por la Unión Europea. La mayoría de las muestras tenían niveles de OTA por debajo del límite de detección del método utilizado, que es de 2 ppb. Aspergillus spp. fueron los hongos más comunes en todas las muestras, con Aspergillus niger teniendo la mayor incidencia (31%). No se encontraron diferencias significativas en los niveles de OTA entre los granos verdes y granos tostados.