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dc.contributor.advisorMartínez-Cruzado, Juan C.
dc.contributor.authorDíaz-Matallana, Marcela
dc.date.accessioned2018-09-11T17:49:51Z
dc.date.available2018-09-11T17:49:51Z
dc.date.issued2009
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.11801/844
dc.description.abstractIn an effort to gain a better understanding of the migratory processes related to the peopling of the Caribbean, the aim was to characterize Native American mtDNAs from Colombia and Venezuela and compare them to their Puerto Rican counterparts. This is the first work that integrates sequencing information of the mtDNA from northern South America, Colombia and Venezuela, with Puerto Rico. Up to date, only isolated mtDNA studies have been carried out in each of these countries. Sixty-one samples from unrelated volunteers were obtained from Colombia (Andean Region and Atlantic Coast), and Venezuela. Mitochondrial HVR-I and HVR-II sequences were aligned and compared to the rCRS, showing that 93.4% of the mtDNA samples were of Amerindian origin. Participants of Northern South America, belonged to haplogroups A (44.26%), B (31.14%), C (11.47%), D (6.55%), L (4.91%), and U (1.63%). Northern South America and Puerto Rico shared mutations mainly in Native American haplogroups A and C. Genetic diversity measures and neutrality test statistics were performed. An individual from Venezuela (VE6) belonging to haplogroup C exhibited ancient mutations related to lineage C-II, a Puerto Rican lineage believed to have arrived to the Greater Antilles in Pre-Arawak times. Through coding sequence determination and restriction analysis it was shown that VE6 belongs to the Native American C1b clade, and to the RFLP haplotype AM 32, which supports a South American origin for Puerto Rico. In addition, two individuals from Colombia (S2) and Venezuela (VE1) classified as belonging to haplogroup A showed the 16129 transition that defines lineage A-VIII of Puerto Rico. This transition has been found in the extinct Ciboneys of Cuba, and North, Central, and South American tribes, plus modern Dominicans. Therefore, the origin determination of this Puerto Rican lineage will require complete mtDNA sequencing of the latter samples. It would be recommendable to expand the sampling of the Caribbean Coast of Colombia, and Venezuela with the purpose of finding more connections with Puerto Rico and helping in the reconstruction of the pre-Columbian migrations to the Caribbean.
dc.description.abstractEn un esfuerzo por lograr una mejor comprensión de los procesos migratorios del poblamiento del Caribe, el objetivo de este trabajo fue caracterizar los ADNmts indígenas de Colombia y Venezuela, y compararlos con sus homólogos de Puerto Rico. En realidad, éste es el primer trabajo que integra la información de secuencia del ADNmt del norte de Suramérica, Colombia y Venezuela, con Puerto Rico. Hasta ahora, sólo se han realizado estudios aislados del ADNmt en cada uno de estos países. Sesenta y una muestras de voluntarios no relacionados se obtuvieron de Colombia (Región Andina y la Costa Atlántica) y Venezuela. Las secuencias ADNmt HVR-I y II fueron alineadas de acuerdo con la rCRS, demostrando que el 93.4% de las muestras de ADNmt fueron de origen Amerindio. Los participantes del Norte de Suramérica, pertenecieron a los haplogrupos A (44.26%), B (31.14%), C (11.47%), D (6.55%), L (4.91%), y U (1.63%). El norte de Suramérica y Puerto Rico, compartieron mutaciones principalmente en los haplogrupos A y C. Se realizaron medidas de diversidad genética y pruebas estadísticas de neutralidad. Un individuo de Venezuela (VE6) perteneciente al haplogrupo C exhibió mutaciones antiguas relacionadas con el linaje C-II de Puerto Rico, el cual se cree habría llegado a las Antillas Mayores en la época pre-Arahuaca. La determinación de la secuencia codificante y un análisis de restricción demostró que VE6 pertenece al clado americano nativo C1b, y al haplotipo de RFLP AM 32, lo cual apoya un origen suramericano para Puerto Rico. Además, dos individuos de Colombia (S2) y Venezuela (VE1) clasificados como haplogrupo A evidenciaron la transición 16129 que define el linaje A-VIII de Puerto Rico, transición encontrada en los Ciboneyes extintos de Cuba, en tribus de Norte, Centro y Suramérica, además en dominicanos modernos. Por lo tanto, para la determinación del origen de este linaje de Puerto Rico será necesario secuenciar completamente el ADNmt de estas últimas muestras. Sería recomendable ampliar el muestreo de la Costa Caribe de Colombia, y Venezuela con el propósito de encontrar más conexiones con Puerto Rico y ayudar en la reconstrucción de las migraciones pre-Colombinas al Caribe.
dc.language.isoenen_US
dc.subjectmtDNA from northern South America, Colombia and Venezuelaen_US
dc.subjectmtDNA studiesen_US
dc.subjectNative American mtDNAs from Colombia and Venezuelaen_US
dc.subject.lcshIndians of South America -- Migrationsen_US
dc.subject.lcshIndians -- Caribbean Areaen_US
dc.subject.lcshMitochondrial DNA -- Caribbean Areaen_US
dc.subject.lcshDNA -- Analysisen_US
dc.subject.lcshPhylogenyen_US
dc.subject.lcshVariation (Biology) -- Caribbean Areaen_US
dc.titleIn search of pre-columbian migrations to the Caribbean: indigenous mitochondrial DNA from Northern South Americaen_US
dc.typeThesisen_US
dc.rights.licenseAll rights reserveden_US
dc.rights.holder(c) 2009 Marcela Díaz-Matallanaen_US
dc.contributor.committeeMontalvo, Rafael
dc.contributor.committeeMuñoz, Carlos A.
dc.contributor.representativeSmith, Matthew
thesis.degree.levelM.S.en_US
thesis.degree.disciplineBiologyen_US
dc.contributor.collegeCollege of Arts and Sciences - Sciencesen_US
dc.contributor.departmentDepartment of Biologyen_US
dc.description.graduationYear2009en_US


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