Publication:
Study of an ARS-like function of map units 88-100 of parvovirus LUIII

dc.contributor.advisor Diffoot-Carlo, Nanette
dc.contributor.author De Jesús-Maldonado, Idaris
dc.contributor.college College of Arts and Sciences - Sciences en_US
dc.contributor.committee Gill-Eccles, John
dc.contributor.committee Massol-Deyá, Arturo
dc.contributor.department Department of Biology en_US
dc.contributor.representative Laboy, Jorge
dc.date.accessioned 2018-08-09T14:30:47Z
dc.date.available 2018-08-09T14:30:47Z
dc.date.issued 2004
dc.description.abstract The synthesis of minus strand by parvovirus LuIII requires replication from the left palindrome of the plus strand DNA. An origin of replication yet to be identified must be present at the right end of the minus strand, required for the synthesis of plus strand. Parvovirus LuIII contains a unique A/T-rich sequence that shares a sequence homology with the autonomously replicating sequences (ARS) found in yeast. To test if the A/T rich region and sequences downstream the A/T sequence are responsible for autonomous replication, nucleotides 4527 to 5135 of LuIII were cloned (pUraLu88- 100) into a vector containing the URA3 gene as an auxotrophic marker. pUra-Lu88- 100 was transformed into Saccharomyces cerevisiae (SEY S288C,ura3-) by the electroporation method. Plasmid DNA was isolated from the resulting colonies and transformed into Echerichia coli DH5α cells. Analysis performed to the plasmid rescued from yeast indicate that pUra-Lu88-100 was capable of existing in a free state in S. cerevisiae, suggesting that the elements required for a limited ARS-like function are present in at the right end of the LuIII viral genome. en_US
dc.description.abstract La síntesis de la hebra negativa por el parvovirus LuIII requiere la replicación del palindrome izquierdo de la hebra positiva de ADN. Un origen de replicación que no a sido identificado debe estar presente en el extremo derecho de la hebra negativa. El parvovirus LuIII contiene una secuencia única rica en A/T que comparte homología con las secuencias de replicación autónoma encontradas en levaduras. Para evaluar si la región rica en A/T y las secuencias río abajo de ésta son responsables de replicación autónoma, los nucleotidos 4527 a 5135 de LuIII fueron clonados (pUraLu88-100) en un vector que contenía el gene URA3 como un marcador auxotrófico. pUra-Lu88-100 fue transformado en el S. cerevisiae (SEY S288C, ura3 -) por el método de electroporación. El ADN del plásmido fue aislado de las colonias resultantes y transformado posteriormente en células del E. coli DH5α. Análisis realizados al plásmido rescatado de la levadura indican que el clon pUra- Lu88-100 fue capaz de existir en un estado libre en S. cerevisiae, sugiriendo que los elementos requeridos para llevar a cabo replicación autónoma limitada similar a la descrita para ARS están presentes en el terminal derecho del genoma viral de LuIII. en_US
dc.description.graduationYear 2004 en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.11801/800
dc.language.iso en en_US
dc.rights.holder (c) 2004 Idaris De Jesús-Maldonado en_US
dc.rights.license All rights reserved en_US
dc.subject Parvovirus LuIII en_US
dc.subject A/T-rich sequence en_US
dc.subject Saccharomyces cerevisiae (SEY S288C,ura3-) en_US
dc.subject Echerichia coli DH5α cells en_US
dc.subject LuIII viral genome en_US
dc.subject.lcsh Parvoviruses en_US
dc.subject.lcsh Viral genomes en_US
dc.subject.lcsh Escherichia coli en_US
dc.subject.lcsh Nucleotide sequence en_US
dc.title Study of an ARS-like function of map units 88-100 of parvovirus LUIII en_US
dc.type Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
thesis.degree.discipline Biology en_US
thesis.degree.level M.S. en_US
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